关于自体肾移植，其实不存在排斥反应，因为自体肾移植多数是因为肾脏如血管周围有肿瘤或者有东西压迫等，造成肾脏无法放在原来的位置，把它从自己身上切下来，放在另外一个位置。这时候肾脏还是自己的，所以不是外来物，身体的免疫系统认识它，所以不会发生排斥反应，没有必要吃抗排斥药物。但是其它肾移植的并发症风险存在，如血管与血管接在一起，漏血、狭窄，输尿管与膀胱接在一起，也存在漏尿和输尿管狭窄等各种风险，但是不存在排斥反应。
做肾移植的大部分患者是异体肾移植，身体把肾脏当成外来的侵入物，当成和细菌、病毒类似的侵入，免疫系统要想方设法把它踢出去，则引起排斥反应，需要吃大量的抗排斥药物压制免疫系统。所以，讲究肾移植配型，配型好以后排斥反应要低一些。
