不吃早饭主要危害胆囊和胃。胆囊用于储存浓缩胆汁，进食时胆汁会从胆囊内释放，参与蛋白质及脂肪的消化、吸收。不进食时，胆汁将在胆囊内浓缩、储存。长时间不进食，会引起胆汁在胆囊内异常浓缩、储存，长此以往胆囊内会形成胆固醇结晶，进而形成胆泥。
由于胆泥对于胆囊为外源性刺激，刺激局部发生炎症后，形成胆囊结石，甚至部分结石将刺激胆囊，出现胆囊息肉。则经常早上不吃饭的人体检时常发现，胆囊炎症、胆囊结石、胆囊息肉的发病率比正常人高许多。此外，长时间不进食会引起胃内发生炎症，胃酸增多对胃黏膜造成损伤，导致胃糜烂，甚至溃疡病。
