尿痛的病因通常是泌尿系感染。当泌尿系出现感染时，通常一些细菌比如大肠杆菌、表皮葡萄球菌，是由尿道外口沿着尿道入侵，进入尿道黏膜上皮以及膀胱黏膜上皮，造成相应的细胞充血、水肿，里面的神经纤维外露，或者变得更加敏感，从而导致临床上经常说的膀胱刺激三联征，尿频、尿急、尿痛。
由于该病是由于细菌的感染入侵所致，所以在治疗上一般采用抗生素进行治疗，常用的抗生素如左氧氟沙星、头孢菌素、磷霉素，治疗的周期一般是1-2周。等再次复查尿常规时，尿常规中白细胞转阴，方标志着治疗结束。
在治疗尿痛的同时，除了用药，还推荐饮食要清淡，不要喝酒，不要喝浓茶、咖啡这些刺激性的食物和饮品，同时配合多喝水，尿痛将会在1-2周很快缓解。
