甲状腺是内分泌的器官，如果不做手术属于内分泌、内分泌内科，如果需要做手术，目前最多在普通外科，甚至甲状腺外科和乳腺外科等，还有的分为甲乳外科，主要需看疾病是属于哪个科室，其临床常见疾病一般如下：

1、原发性甲状腺功能亢进：现在内科治疗效果很好，通过药物治疗以后，甲状腺功能亢进的症状能够得到明显缓解，不需要外科手术介入，此时就在内分泌科治疗即可，但是个别患者的原发性甲状腺功能亢进，内科治疗以后效果不好以及对药物不能耐受，甚至药物对患者会产生不能耐受的副作用，比如引起白细胞明显降低等，需要外科干预，因此原发性甲状腺功能亢进在内科治疗阶段能够好的就内科治疗，不能好的需转到外科进行治疗；

2、甲状腺功能低下：一般需要内分泌科进行治疗，即补充甲状腺素；

3、甲状腺炎：比如急性甲状腺炎、亚急性甲状腺炎甚至、慢性淋巴细胞性甲状腺炎，这些炎症变化也需要内分泌科进行治疗；

4、其它疾病：但对于结晶性甲状腺肿、甲状腺腺瘤、甲状腺癌这样需要手术治疗的，属于外科处理。