肛门止痛药一般在15分钟即可见效，常用方法是使用局部止痛膏，比如复发利多卡因乳膏和复方甘菊利多卡因凝胶，当肛门疼痛的时候挤在肛门内，一般15分钟左右则会见效。如果使用的是全身止痛药，比如止痛针，也是在使用十几分钟后即可见效。但如果是使用口服的止痛药，如曲马多止痛片，疼痛缓解需要的时间可能更长一些，因为口服止痛药需要经过口服到胃内吸收，然后进入肠道，可能需要1-2个小时。
肛门止痛药的起效时间主要与起效药物的种类和给药的方式有关，但还取决于疾病的原因。如果是肛裂引起的疼痛，在肛门局部使用止痛膏，可能十几分钟则会缓解。而如果疼痛是由于肛周脓肿引起，则肛门用药的效果不佳，可能需要打止痛针或需要手术治疗。
