如果是急性扁桃体炎，最主要的是要进行抗生素治疗，抗生素原则是选择最有效、最敏感的抗生素，如在急性扁桃体炎感染里，最常见的是各种各样的球菌感染、肺炎双球菌、金黄色葡萄球菌类感染，比较有效的是青霉素类或者头孢类药物进行治疗。
除此以外，喹诺酮类、克拉霉素类红霉素药物也可以进行治疗。如果确定是急性扁桃体炎，一般都要用足量、足够疗程的抗生素进行治疗，千万不要稍微好转就停药。
还有一种是慢性扁桃体炎，扁桃体里面有病灶，反复发作。这种情况就要进行区分，如果长期服用抗生素也不太合适。如果反复发作，可以用中药进行治疗，反复发作的患者需要把扁桃体进行切除。
