胚胎和囊胚是受精卵发育的不同阶段，在体外受精和胚胎移植的技术中，胚胎发育是从第零天的合子，第二天到第四天的卵裂球胚胎，第五天和第六天的囊胚，是胚胎细胞数逐渐增多的不同阶段的称呼。因此，胚胎和囊胚都是胚胎，胚胎移植主要是第三天的卵裂球胚胎和第五天和第六天的囊胚。两者主要的不同是胚胎发育阶段第三天，是胚胎发育的八细胞阶段，八细胞阶段是胚胎具有全能性。理论上如果仅有一个正常的卵裂球，发育的潜力足够，都可能发育成一个正常的个体，胚胎也开始进入一个快速的分裂期。所以这个阶段胚胎的碎片对胚胎的影响相对较小，在发育到第五天形成了好的囊胚，可能胚胎的细胞数达到100多个。囊胚此时可以分成内细胞团和滋养层细胞，细胞开始出现分化。分化的细胞可以行使不同的功能，但是细胞还具有多能性，此时部分细胞中的碎片反而被胚胎吸收，囊胚看上去又更加完美了。
