以前肺部微创手术的麻醉方式，有硬膜外麻醉以及只麻醉肺部的方式，但目前基本已经全部被摒弃掉。符合要求的麻醉方法，需要在进入肺以后，保证呼吸的同时，又能保证供氧。为保障手术的顺利进行和病人的安全，只要是肺部手术，目前基本采取全麻插管术进行麻醉。
在病人全身麻醉后，插入双腔支气管，一侧进行供氧，将做肺手术的一侧肺隔离，保证手术进行，另外一侧进行肺通气，保证手术病人的安全。肺部微创手术虽然是微创，手术麻醉方式的选用，通常也是进行全身麻醉后插双腔支气管，可以保证手术的顺利进行和病人的安全。医生也会采取一些相关的镇痛方式，如硬膜外镇痛、肋间神经阻滞、椎旁神经阻滞等，以保障手术中的镇痛效果。
