生化检查只能反映肝功能是否正常，而不能判断是否有脂肪肝。脂肪肝的诊断，通常简单的是依靠肝脏的超声检查，也可以行肝脏CT检查，还可以做肝脏瞬时弹性成像测CAP指标，从而判断是否有脂肪肝，而生化指标只反映出肝功能是否正常。
一般在体检时，轻度脂肪肝的生化指标可以属于正常水平，而肝脏彩超和CT检查可表现出脂肪肝特征。如果脂肪肝出现肝脏损伤，则表现为转氨酶升高，甚至表现为胆红素升高，此情况称为脂肪性肝炎，比单纯性脂肪肝情况较严重。如果通过影像学检查，不能确定是否有脂肪肝，可以做肝脏穿刺检查，肝组织病理检查，判断是否有脂肪肝。脂肪肝检查中，做肝脏瞬时弹性成像检查、肝脏CT检查以及肝组织病理检查，还可以将脂肪肝分为轻、中、重度。
