阴茎红肿、疼痛，通常考虑是包皮龟头炎或者阴茎的炎症。这种情况下其主要治疗以抗感染治疗为主，可以根据常用的经验选用青霉素类、头孢类、喹诺酮类、大环内酯类。甚至对于真菌感染，可以采用一些抗真菌的药物，包括口服或者外用的药物进行使用。
包皮龟头炎通常临床上比较常见，其可以引起阴茎的红、肿、疼痛、糜烂，伴有分泌物，局部可采用清洗剂，如高锰酸钾或者百多邦(莫匹罗星软膏)等软膏进行外用，也可以采用口服的抗生素来进行治疗。
对于阴茎本身的炎症，如果症状比较重，也可以采用静脉的抗感染治疗，待症状缓解后，逐步过渡到口服的抗感染治疗。一些性传播疾病如淋球菌、支原体、衣原体也是导致阴茎感染的原因之一，在临床上要针对性选用一些药物。
