根管治疗如果分4次进行，一般第一次最痛。因为第一次要在高速牙钻的钻磨下将牙齿上开一个洞，然后通过这个洞将根管内发炎的牙神经清理干净。如果牙神经没有完全坏死的情况下，患者有一定痛觉，因此在清理时就会有疼痛的感觉。
此后由于牙齿根管、牙髓腔内已经没有牙神经，因此在后续治疗过程当中，根管治疗器械如果没有穿出根尖孔外，患者一般不会有疼痛的表现。所以无论根管治疗是4次完成，还是3次完成，只有在第一次治疗时，会因为牙神经的不完全坏死，而导致患者在治疗时可能有疼痛的表现。而其它几次的治疗，患者一般不会有疼痛。
