甘脯二肽氨基肽酶主要分布在肝脏和肾脏，所以一般情况下，如果有肝脏的损伤，比如一些急慢性肝炎，或者是慢性的肾脏的疾患，比如慢性肾小球肾炎或者肾病综合征等，甘脯二肽氨基肽酶可能会超出正常值的范围要高一些。
当然，临床上在诊断肝损伤和肾脏损伤的时候，对于甘脯二肽氨基肽酶的参考不是放在首要的。像肝损伤的时候，主要是参考谷丙转氨酶和谷草转氨酶的水平，还有血浆胆红素的水平，再结合肝脏的影像学的检查，结合流行病学史来进行肝脏疾患的判断。
对肾脏疾患，也是依靠肾功能的检查、尿液成分的分析，还有肾脏的超声检查来判断肾脏的疾患。甘脯二肽氨基肽酶不是作为主要的参考内容，只是发现在肝脏损伤的情况下，或者有肾脏疾患的情况下，这个酶会随之升高。
