HPV病毒有200个亚型，不同亚型的感染，可以感染不同的部位，引起不同的临床表现。长于面部主要是1型、2型和4型，叫扁平疣。对于扁平疣的治疗，数量小的情况下可以使用物理方法，比如冷冻、激光去除，数量多的情况下必须口服药物联合物理治疗。长在手上会形成寻常疣，即手上的瘊子。这种寻常疣只能通过物理方法去除，冷冻或者激光。长在脚底叫跖疣，这种跖疣的治疗，可以通过冷冻、激光和平阳霉素封闭治疗。发生于生殖器部位的HPV感染，叫生殖器疣，或者尖锐湿疣，是一种性病。可以口服抗病毒药物，联合外用的物理治疗，激光、冷冻、光动力治疗等。
