超声肠镜注意事项和普通胃镜大致相同。首先需要将肠道清理干净，需要吃泻剂将肠道积存粪便完全排泄、代谢掉。有时候比常规肠镜要求严格，超声肠镜除需要将肠道清洗干净，还需要往里注入水剂，这水是无气水，即蒸馏水，因为超声最怕气体，无气水能更好通过超声波，能够更好进行超声家检查。

主要的肠道准备情况，病人往往是在清醒状态下做，病人能够配合翻身，能够找个最佳体位来进行检查，痛苦和做肠镜痛苦一样。