唾液作为一种体液，通常与全身多种疾病密切有关。唾液量的检查可以作为风湿免疫性疾病的重要指标，比如干燥综合征，唾液量的检查可以反映出唾液综合征的辅助性诊断指标。唾液位于口腔环境中，唾液内菌群变化，可以反映口腔内菌群变化情况，在临床上对口腔菌群的检查，通常从唾液中取材。
唾液作为体液内含的标志物，可作为肿瘤性疾病，或者内分泌系统疾病的重要取材位置。另外唾液中含有大量蛋白成分，与血液内的蛋白变化密切相关，因此唾液中蛋白成分以及量变化，反映血液当中的蛋白水平变化。全身其他感染性疾病，如艾滋病等，经临床研究也可以从唾液当中取材，进行化验和分析后可作为艾滋病的诊断。唾液由于取材方便、没有创伤等优势，受到临床中越来越多的关注。
