一般需根据伤口类型选择合适的消毒药水，消毒前需明确伤口是皮肤或是黏膜受损，黏膜包括口腔以及肛门附近的黏膜等。对于皮肤上的普通伤口，可用双氧水、生理盐水、蒸馏水等进行冲洗，特别浅表的伤口可用酒精和碘酒进行消毒。而对于皮肤较深的伤口，需注意清除其中的异物，最好用水和双氧水反复冲洗，保证伤口内无异物时再进行缝合处理。
对于黏膜伤口，可用双氧水、洗必泰(氯己定)消毒液、新洁尔灭消毒液等进行消毒。此时一般不建用酒精，因其刺激性较大，一般浓度70%以上的酒精仅限于浅表皮肤消毒。为避免刺激黏膜伤口，可用碘伏进行消毒处理，目前推荐的较好的消毒药水包括双氧水和碘伏。但碘伏不同于碘酊，碘酊是含有酒精性的消毒药水，对伤口刺激较大，较深的伤口一般不建议使用。
