牙齿根部如果有黑色硬质，最有可能是出现牙结石，还有可能是由于色素沉着所导致，也极有可能是由于龋病所出现了黑色硬质，也就是龋坏组织，并且伴有一定的腐坏和食物嵌塞。

如果出现这个问题，建议患者尽早到正规医院口腔科，或口腔医院的牙体牙髓病科，找专业的口腔科医生进行仔细检查，可以通过专业的口腔检查，如探诊、视诊以及叩诊。

必要时要进行辅助检查，如牙片，即全口曲面体层片的检查，通过这些检查以后再进行相应诊断。如果是由于龋坏所导致，应该及时去龋，进行后续充填修复。

如果是由于龈下结石，可能要进行全口洁治，不仅要进行龈上洁治，尤其是要进行龈下刮治，就可以将牙齿根部黑色的东西进行彻底去除。如果是由于一些腐坏组织，并且伴有食物嵌塞，也可以通过洁牙的方法进行去除，并且要进行口腔维护等。