男性性功能检查应该去找男科医生，男科医生可能会在专门男科或者男性科，也可能会在生殖中心的男科或者泌尿外科，要根据医院科室的设置情况而定。
部分医院有男科医生，或者存在专门的男科，去找专门男科进行检查没问题。有些医院没有专门男科，可以去找生殖中心的男科医生来进行诊断。如果既没有男科，也没有生殖中心，只能去泌尿外科找男科专业的泌尿外科医生来进行诊断。
性功能检查分为一般检查和特殊检查，一般检查包括血尿常规、生化全项、血糖、血脂及性激素检查；特殊检查有夜间勃起监测、神经肌电图检查及阴茎血管彩超、性功能特殊检查。
这些检查并不是在所有医院都能做，可能只是在专门的男科科室可以开展这些性功能检查。像生殖中心男科，一般都不能做这些性功能检查，因为生殖中心男科可能都是以男性不孕不育作为主要的诊疗对象。
在泌尿外科中，可能可以做这些检查，但是对于有性功能障碍的男性，还是建议要找专门的公立医院男科去进行检查。
