CT检查在神经科，即完成头部的CT平扫，怀疑脑出血或者蛛网膜下腔出血等出血性疾病时，首选CT检查。因为CT对出血性疾病非常敏感，CT上突然出现的高密度信号、高密度病变，则可能提示是出血性的改变或者钙化，与以前的图像对比，可很快判定是否存在出血的情况。
对于脑血管病，如脑梗，发病6小时左右，CT即可显示比较大的病灶。即使是在早期，也有征象提示，比如皮髓质界限不清，大脑中动脉高密度征等，有助于判断。CT与核磁相比，优势为CT的检查受到的限制较少，比如有心脏起搏器、人工关节等情况下，仍然可以进行CT检查，但这一类患者可能无法进行核磁的检查。CT检查用时较短，对于病情比较危重的患者，短时间的筛查也比较适合用CT完成。
