小宝宝嘴巴溃疡大多数的原因是病毒感染，所以最主要的处理方法是对症处理，使用一些促进溃疡恢复的药物，尽快恢复，减轻症状，防止溃疡引起不爱吃东西、流口水比较多的这些表现，另外预防继发的细菌感染，这是最主要的处理原则。
因为大多数小宝宝的口腔溃疡，都是由于疱疹病毒感染所引起，如柯萨奇病毒，是比较常见的疱疹病毒，有的是单纯疱疹病毒，是在嘴角、口周之类的部位起溃疡，柯萨奇病毒会在口腔里起溃疡。
也有常见的说法是小宝宝溃疡是由于上火等引起，上火从西医上看一般都是指的病毒感染，而这种病毒一般没有特殊的抗病毒药物，所以主要是对症处理，比较常用的如外用溃疡散，喷上后很快一般2-3天就能愈合缓解。
但有一部分小宝宝如果是反复的口腔溃疡，而且每次溃疡都比较深，称为复杂溃疡，这是口腔黏膜的一种疾病，需要去儿童的口腔科进行专门诊治，可能不是病毒感染引起，不是常见的小宝宝的嘴巴溃疡。
所以当小宝宝嘴巴有溃疡时一般对症处理即可，外用药物或西瓜霜喷剂、溃疡散，一般处理以后会好转。
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