无痛胃镜其实是静脉不插管麻醉，也是全身麻醉的一种，但用药比通常的全凭静脉麻醉小，用药维持患者不痛和镇静，保证正常呼吸来完成手术。因为无痛胃肠镜手术刺激比较小，所以药只需要维持到比较镇静的程度和比较无痛的程度便可以。无痛胃镜麻醉其实跟普通全麻一样，需要开放静脉用静脉麻醉药。
无痛胃镜的麻醉是保持呼吸的不插管全静脉麻醉。术前按照全麻来进行准备工作，如有些患者要禁食禁饮一段时间。在整个过程中患者没有知觉，但患者有呼吸，这时稍微用静脉药便可以。有时候会用小剂量止痛药完成手术，因为该手术是比较小的手术，刺激比较小，所以用量也小。