试管婴儿与正常婴儿的区别，主要在于试管婴儿的受精和早期胚胎发育过程在体外完成。但两者的出生情况，包括畸形发生率，以及智商、远期发展，目前没有区别。正常自然妊娠的受精场所是在输卵管壶腹部，胚胎早期发育也在子宫内完成。而试管婴儿是将母亲卵子取出后，与父亲精子在体外完成受精过程。同时在胚胎发育的前3天，或前5-6天，是在体外培养形成胚胎或囊胚，然后才种植到母亲子宫内，这是试管婴儿与正常婴儿的最主要区别。

但试管婴儿的预后，总体而言，并没有明显增加先天畸形的风险，同时试管婴儿的后代，无论是从智商还有日后的日常发育过程，也与正常婴儿没有明显区别。有研究发现，虽然试管婴儿的早产率和流产率，可能要高于自然妊娠，但这主要与试管婴儿母亲普遍高龄，以及试管婴儿多胎的发生率增高有关。因此建议有指征的患者，可以考虑单胚胎移植，减少多胎风险，以减少流产和早产的风险。