扁桃体发炎进行按摩，并没有确切疗效。目前没有任何规范的研究证明，按摩对于扁桃体发炎有确实疗效，所以不建议使用。此外按摩还可能增加扁桃体的触痛程度，所以不建议使用按摩治疗扁桃体发炎。
扁桃体发炎，通常要根据病情轻重、病程时间长短，以及可能的病原菌进行适当的治疗。如果是急性非化脓性扁桃体炎，通常考虑和病毒感染有关。一般咽痛会比较轻微，发热会在三天之内逐渐退烧，一般说明问题不大，可以观察，上述症状一般会在一周左右逐渐缓解和自愈。
如果扁桃体发炎出现明显化脓、咽痛持续加重，而发热持续超过三天仍然不退热，则考虑细菌感染的可能性较大。此时需要使用青霉素类的药物，比如阿莫西林治疗，10天才会有比较好的疗效，并有效预防复发。
如果是慢性扁桃体炎，通常和胃酸反流刺激导致的反流性咽喉炎有关。要适当地使用抑制胃酸的药治疗，才能取得好的疗效。
