地衣芽孢杆菌活菌胶囊主要起到调节胃肠道菌群的作用。口服之后能在胃肠道发挥治疗作用，能够释放出具有抗菌作用的物质，并且能拮抗某些有害致病菌的生长，对于葡萄球菌、酵母样菌，都具有拮抗作用。另外，还能促进部分有益菌的生长，比如双歧杆菌、乳酸杆菌，以及部分链球菌等。
地衣芽孢杆菌活菌胶囊能够提供无氧环境，促进肠道的厌氧有益菌的生长及恢复。在临床上主要用于缓解急性、慢性腹泻，由于胃肠道菌群失调所导致的其他胃肠道不适。由于此药物是一种活菌制剂，因此在存放时应该避免放置于高温处，并且在服用时，也避免使用过热的水。不能与抗生素联合使用，如果确实需要同时使用这两种药品，一定要间隔三小时以上。
