手足口病的早期症状包括发热、咽部不适以及食欲不振，这些是呼吸道感染的常见症状，没有特异的症状。
随着发热、咽疼这些症状，孩子慢慢会出现手足之间的疱疹，一般指缝、脚掌以及手掌之间有疱疹，以及存在咽部疱疹，这时候孩子往往伴有低热、咽部疼痛加剧。
手足口病是由一组病毒引起的综合征，不是由单一病毒引起。常见的引起手足口感染的病毒有肠道EV71病毒，可以引起重型手足口病，往往发生在年龄较小的孩子，年龄越小，症状越重。
严重的病人除了皮肤黏膜皮疹、发热以及呼吸道不适的症状，还会有病毒性心肌炎或病毒性脑炎，这些重症症状危及生命，可以引起呼吸循环的衰竭。
预防手足口病很好的措施是接种手足口病毒疫苗，目前临床上，有EV71灭活的病毒疫苗，对于减少重症手足口病有着非常重要的意义。
