自体脂肪丰胸的副作用主要是感染。如果注射了自体脂肪，由于无菌操作的不严格引起了感染，就会形成比较严重的并发症，无论是抽脂肪的供区，还是注射接受脂肪的乳房区域形成的感染，一定要及时到医院治疗。
另外，注射不是很均匀，注射以后可以摸到硬结，这些硬结有的可以随着时间慢慢消退，有的不能消退。不能消退的硬结会形成一个长期的并发症，主要还是可以触及到硬结，虽然从外观上可能不明显，但是摸起来的触感很不好。对于比较大、比较集中的硬结，可以通过手术单个切取，对于散在、较小的硬结，一般建议还是观察，不做特殊的处理。
