CT检查及磁共振检查存在不同优势，二者检查的重点不同，针对疾病的敏感度也不同，需根据疾病进行相应的分析。头颅CT通常对脑出血敏感性较高，若患者存在出血，则首选头颅CT。但若患者怀疑存在脑梗死，则应首选磁共振，因为磁共振对脑梗死的鉴别更清楚、直观，并且可以准确判断脑梗死的部位、大小以及体积。此外，在脑梗死急性期通常需进行CT检查。
脑出血与脑梗死的鉴别存在一定的难度，对于怀疑存在脑梗死或脑血管病的患者，应首先进行CT检查以明确是否存在出血。若排除出血的情况，但存在脑血管性的表现且起病较急，则怀疑为脑梗死，所以有必要在急性期进行CT检查。
