卵巢妊娠一旦确诊，最终的结局是流产或者破裂，在腹腔内出血会引起腹痛和阴道流血，后果是比较严重的。所以一旦确诊为卵巢妊娠，要尽早把病人收住院。如果是出血或者流产症状发生不是很明显，可以进行腹腔镜手术，把胚胎组织取出；如果出血特别多，导致失血性休克，也可以做剖腹探查手术。由于腹腔镜手术技术迅速的发展，近几年也是以腹腔镜的手术开展诊断或者治疗，开腹手术较少。手术过程当中可以根据妊娠的部位选择保守性的手术还是破坏性的手术，即根治性的手术。保守性手术，可以进行卵巢的部分切除，把胚胎的部位切除，保留卵巢的功能；也可以做卵巢的楔形切除，或者直接把卵巢或者患侧的输卵管全部切掉，称为根治性的手术。
