心脏射频消融术是微创手术，也是有创的检查，是通过穿刺血管到达心脏的一种治疗手段。从心脏到血管的路径中，导管所经过的地方都有潜在的可能会对血管和心脏造成相应的损害。虽然人与人的解剖结构大部分都一样，但还是会存在细微差距。有些患者可能会潜在带来部分副作用，这种概率是存在的。随着技术的革新、设备的改善，在广泛使用的三维标测系统下，以及广泛应用的压力导管，均大大地增加了射频消融安全系数，而且成功率也大大提高。它能明确的显示，导管和组织的贴合程度，在体外就能够看到，从而指导治疗，这是别的方法达不到的。
此外，射频消融需要采用X线引导，患者需要在X线透视的下，虽然射线量相对较低，部分孕妇暂且还不能接受治疗，或者有怀孕需求的人群，不建议做射频消融治疗，毕竟X线对于人体和胎儿都有一定影响。
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