卵巢囊肿病因仍不明确，目前认为与遗传因素、内分泌失调、生活方式、环境因素等有关，具体如下：
1、遗传性因素：据统计20%-25%的卵巢囊肿患者，都有家族史；
2、内分泌因素：我们知道卵巢是排卵、分泌性腺激素的重要器官，卵巢的肿瘤多发生于生育期年龄，临床上很多卵巢囊肿的患者，和多囊卵巢综合征患者，基本病理生理改变是卵巢产生过多的雄激素，而雄激素的过量产生，是由于体内多种内分泌系统功能异常协同作用的结果；
3、生活方式：长期的饮食结构、生活习惯不好，心理压力太大，可以出现生理性卵巢囊肿，以及有些卵巢的真性肿物；
4、环境因素：比如食物的污染，蔬菜等使用的植物生长激素，如家禽等，复方配方中的瘦肉精等激素。近年来在我国随着生活水平的提高，饮食习惯的改变，以及一部分中青年女性，滥用一些丰乳、减肥，以及延缓衰老等的激素类的药物和滋补品，这些都有可能使卵巢肿囊肿呈高发性、年轻化的趋势。
