自闭症的病因目前还不太明确，很多证据也支持孤独症是各种生物学因素所致的一种精神神经发育的综合征。但是目前很多科研还是倾向于遗传因素，因为目前认为遗传因素可能是主要影响孤独症患儿的一个重要的因素，包括病毒感染、免疫系统缺陷、神经系统疾病。

有的还说是母孕期不良饮食，包括维生素缺乏，也可能会起到部分作用，但是最终结果统一都会造成脑结构神经传导异常，还有脑组织改变，最终导致脑功能受损。临床上常见的一些家长认为自己的孩子平常就是语言障碍，平常与其它孩子说话少，或者可能就是因为看电视、玩手机多了，导致他不交流、自闭，其实这种是非常错误的一个观点，我们平常说的自闭症也就是孤独症，是广泛性的发育障碍的代表性疾病，可以说是一种终身性的疾病，而不是说一种生理疾病。

一般先天性的脑功能发育障碍可能会由于教育、生活环境或家庭的教育环境有一些问题而诱发的一个疾病，所以目前这个是不是天生的问题，不用纠结，因为我们还是倾向于遗传因素，还有其它各方面因素引起的，主要针对这种孩子，做一些相对症的治疗是最关键的一个点。