男孩阴茎疼的常见原因如下：

1、阴茎炎或包皮龟头炎：炎症会诱发局部筋膜、包皮感染，外观红肿同时伴有压痛。男孩包皮口或尿道外口有血性或脓性分泌物，同时包皮水肿明显，甚至有水泡或脓泡形成。该病情出现的原因可能与天气炎热、饮水少、活动量大、出汗多而排尿少有关。因此出现上述情况时建议让男孩多喝水、多排尿，让尿液冲刷局部，会起到较好的治疗作用；

2、包皮过长：易滋生局部细菌，诱发局部皮肤或软组织感染。除让男孩多喝水、多排尿外，还可以使用红霉素眼膏均匀涂抹于包皮、尿道外口或阴茎体周围，起到较好的消炎止痛作用。通常经过1-2天的治疗，疼痛、肿胀感觉会逐步消失。在以后的生活中一定要注意多喝水、多排尿，如果男孩反复发生阴茎体感染或包皮龟头炎，也可以考虑做包皮环切手术；

3、异物：该原因较为少见，如家长不注意时男孩向尿道中塞入异物，从而出现阴茎疼痛，但外观正常。

综上所述对于年龄较小的男孩，需防止尿道存在异物的现象发生。如果较大的男孩阴茎疼痛且局部红肿，则要考虑感染的可能。