替硝唑与甲硝唑都属于硝基咪唑类的抗菌药物，两种药物的作用机制与临床应用基本相同，但是替硝唑可能会比甲硝唑在疗效以及不良反应方面具有一定的优势。甲硝唑属于第一代硝基咪唑类的抗菌药物，替硝唑是甲硝唑的升级产品。在疗效方面，替硝唑的抗菌作用可能要强于甲硝唑；在不良反应方面，甲硝唑可能会导致患者出现胃肠道的反应、血液系统的反应，以及其他的副作用。替硝唑虽然也可能会在此方面发生副作用，但是发生率以及严重程度，可能都会弱于甲硝唑，因此替硝唑在不良反应方面，要比甲硝唑具有更强的优势。
另外，甲硝唑与酒精容易发生双硫仑反应，双硫仑反应是一种比较严重的醉酒样反应，而替硝唑的副作用发生频率可能要少于甲硝唑。总之，替硝唑与甲硝唑属于同一类别的抗菌药物，相比较而言，替硝唑在药物疗效，以及不良反应方面，可能都会强于甲硝唑，但是患者在选择时，也要遵照医嘱的建议，合理选择抗菌药物。
