腔隙性脑梗死的病因如下：

1、高血压：是导致腔隙性脑梗死的直接原因，尤其是慢性高血压，血压控制不佳更易并发腔隙性脑梗死，高血压在腔隙性脑梗死病人中的发生率为45％-90％，且舒张压升高对本病的影响更明显；

2、动脉硬化：腔隙性脑梗死与动脉硬化紧密关联。Fisher用连续切片方法观测证实基底节、内囊区腔隙病灶的供血动脉有严重的脑动脉硬化改变，即节段性的动脉结构破坏、纤维素样坏死或血管坏死。而其他学者也发现髓质动脉中明显的改变是管壁的透明样增厚，并血管管腔的狭窄、各脑区腔隙性脑梗死的频度与脑动脉硬化的程度呈正比；

3、糖尿病：也是引起腔隙性脑梗死常见病因之一。众所周知，糖尿病可导致远端肢体、肾脏、视网膜、周围神经和脑神经的小动脉梗死性病变，但糖尿病对脑的小血管病变的作用尚未明确定位。流行病学的调查结果表明，糖尿病是脑卒中的危险因素之一，但尚缺乏糖尿病和腔隙性脑梗死有直接联系的证据。不过糖尿病时血凝固性和血液黏滞度增高、血小板黏附性增强，无疑可影响脑深穿通支动脉的血流供应，对腔隙性脑梗死的形成有重要作用；

4、其他：包括心源性栓子、动脉源性栓子也可以引起腔隙性脑梗死。