肩肌腱损伤可以采取保守治疗或者手术治疗，具体情况如下：

1、保守治疗：对于大多数患者来说，肩肌腱损伤程度不算严重，保守治疗即可达到恢复的目的。一般需要休息、制动，配合局部急性期冷敷、超短波照射，以及口服塞来昔布胶囊、仙灵骨葆胶囊等，症状严重者可以静脉滴注氟比洛芬酯注射液。患者需要配合康复医生逐渐开始康复训练，恢复肩关节活动范围和功能；

2、手术治疗：对于少数患者来说，肩肌腱损伤的程度比较严重，发生了肌腱的断裂，则需要考虑手术治疗。通过手术能够缝合肩肌腱损伤断裂部位，恢复其完整性、延续性，并在术后短期制动，配合康复训练、冰敷，促进功能恢复，防止局部发生粘连，保证肩关节的灵活性。

综上所述，肩肌腱损伤治疗方法，具体可以咨询运动医学科门诊医生，专科医生会为患者进行详细的分析和进一步的解答，使患者清楚自身肩肌腱损伤的具体部位、严重程度以及范围。并告知患者正确的治疗方法，尽快促进肌腱损伤修复。