口腔溃疡是一种多因素引起的疾病，主要包括：

1、消化系统疾病及消化系统功能紊乱：口腔溃疡与胃溃疡、十二指肠溃疡、结肠溃疡有相关性。研究表明，30%-48%的口腔溃疡患者有消化系统疾病，如腹胀、腹泻或便秘等；

2、内分泌的变化：部分女性患者多在月经期发生，可能与体内雌激素量下降有关。部分女性每逢经期或者行经前后会出现口腔溃疡，用药治疗只能暂时缓解，通常伴有口干、易怒或者是大便干结等症状。临床研究，月经期出现口腔溃疡主要是由于体内黄体酮水平增高，激素水平下降所造成的； 

3、精神因素：部分患者在精神紧张、情绪波动、睡眠状况不佳的情况下，可能与植物神经功能失调有关；　

4、遗传因素：父母双方患有复发性口腔溃疡，其子女发生复发性口腔溃疡的概率达到80％-90％，父母一方有复发性口腔溃疡的，其子女发生率达到50％-60％； 

5、其他因素：维生素的缺乏，比如维生素B12、锌、铁、叶酸等，还有营养不良造成的免疫力低下，也可能造成口腔溃疡的发生。