肛周脓肿的治疗有以下几个方面：

1、手术治疗：首先要切开引流减压缓解患者的疼痛，肛周脓肿现在的手术方式有两种，第一个叫直接切开引流术，手术时间短可以局部麻醉，可以短时间内缓解患者疼痛的迹象，但是它有不好的一点，将来有可能会形成肛瘘。肛门腺感染是肛周脓肿里面最常见的一个致病因素，如果在手术的过程中不去处理感染的肛门腺，势必会形成内口，将来这个内口不关闭会有粪水长时间的流出最终形成肛瘘，还需要二次手术。除了切开引流术，第二种手术方式叫肛周脓肿一次性根治术。所谓一次性根治术，包括第一步将脓腔打开引流通畅，让患者能够明显缓解疼痛。第二步为了预防将来肛瘘的形成，我们要找着感染的肛门腺，把它做处理、封闭，防止将来形成肛瘘。这就是肛周脓肿目前最主要的两种手术方式；

2、抗生素治疗：术后还需要进行抗生素的治疗，因为毕竟肛周脓肿它是炎症感染性疾病，所以还要给他使用抗感染治疗。抗感染治疗有两种情况，第一个早期的肛周脓肿，刚开始形成硬结的过程中还没有形成脓肿的时候，可以使用抗感染治疗，有一部分患者经过抗感染治疗，不会发展到最后形成脓肿。第二种情况是术后的抗感染治疗，脓腔切开以后，手术做了以后，还要预防性使用抗生素防止继发感染；

3、针对一些特殊性的肛周脓肿的治疗，比如溃疡性结肠炎、克罗恩病引起的，一般建议不做特别大的手术。因为这种由原发病造成的肛周脓肿，一旦切开以后不容易愈合。还有一种多见的结核性肛周脓肿，出现以后需要长期换药才能慢慢治愈。