胆碱能性荨麻疹的治疗，首选第二代的抗组胺药物，包括氯雷他定、左西替利嗪、依巴斯汀等这类药物。对于其它的荨麻疹，在治疗上也首选第二代抗组胺药物。第二代抗组胺药物相对于第一代抗组胺药物，如扑尔敏等，通过中枢的血-脑屏障概率会降低，因此对中枢神经系统的抑制作用比第一代抗组胺药物要弱，可能不会出现嗜睡等不良反应。
有的患者在使用第二代抗组胺药物进行控制时，可能不能有效控制荨麻疹，在服用药物时发作。这时可以考虑联合用药或药物加量，如果还是不能有效控制，还可以与酮替芬联合用药进行控制。胆碱能性荨麻疹，通常是在运动后或情绪紧张、激动时发作。有的患者平时不会发作，但是运动后可以发作，可以考虑在不得不运动时服用药物进行控制，如果平时状态比较好，疾病不发作时可以不进行治疗，不服用药物。
