根据隐匿性阴茎的程度不同和具体合并疾病不同，治疗计划不同，具体如下：
1、完全性隐匿性阴茎建议1-3岁时进行手术治疗；
2、有巨大腹股沟斜疝或鞘膜积液的，需先行斜疝或鞘膜积液手术，术后诊断明确再行手术治疗；
3、肥胖儿需要先减肥后再进行确诊；
4、部分隐匿性阴茎可根据阴茎的发育情况以及合并包茎的程度不同，选择保守治疗或者手术治疗；
5、1岁以内的患儿需要合理喂养，控制体重。
一般手术方法分为：传统型手术治疗，此手术出血量多，采用缝合线通常不可吸收，手术后需进行拆线，恢复时间也比较长。激光环切手术，主要采用激光刀环切的方法，在手术中有直接凝血的作用，患者出血量少，恢复较快。
