根管充填后可能会有各种不适，其中也包括咬合酸痛，主要有以下原因：

1、由于根管充填时根充糊剂略微超出根尖孔，刺激根尖周组织而导致咬合酸痛，这种情况一般随着时间的推移，糊剂自行吸收，症状也能够逐渐缓解，就不需要另行处理；

2、冠部的充填体过高，造成咬合创伤而引起咬合酸痛，需要医生调整咬合，降低咬合，恢复正常咬合关系以后，酸痛就能够缓解。

3、根尖区炎症没有彻底清除，或者根管治疗不到位造成，这种情况需要重新进行根管治疗。

如果出现根管治疗后咬合酸痛，可以到主诊医生处先进行检查，确定咬合酸痛的原因，再进行相对应的处理。