传统手术也有并发症，腔镜手术同样也可能存在并发症。随着技术的娴熟，腔镜手术并发症与传统手术并发症相比，并没有很明显的提高，一个是医生的技术水平提高，另一个是由于设备器械的发展。
腔镜手术除了有传统手术切除的并发症以外，还有自己所特有的相关并发症，比如做腔镜手术的时候，要向腹腔灌注二氧化碳气体，该气体就有可能被腹膜吸收，而产生皮下气肿，甚至有气胸，甚至手术中可能由于血管损伤以后，气体会跑到血管中，形成气栓。
另外，腔镜手术本身所具备的并发症，与开腹手术也一样，即手术中可能会引起出血，手术后会引起感染，这些常见的并发症都是与传统的手术所共有的。
腔镜手术由于手术当中，手不能在腹腔中触摸，所以有时候在周围组织的分离过程中，会容易损伤到周围脏器，这也是腔镜手术需要注意的事项。
