快速病理检查的准确性不如常规病理诊断，诊断的精细度更是有较大差距，其诊断一般都是判断性的，能诊断是或者不是，即是肿瘤或不是肿瘤，是良性或恶性。与常规病理诊断相比诊断受限的原因有如下四点：

1、时间有限，一般冰冻报告在30分钟内要汇报给临床医生，导致病理医生考虑可能不是十分周全；

2、制片效果比较差，质量差的HE切片严重影响病理医生诊断；

3、参与的病理医生少，一般两个左右，疑难病理就得不到充分的讨论；

4、快速切片取材有限，大多数是取一块或者两块，会加大漏诊的可能性。如甲状腺微小乳头状癌在冰冻时经常漏诊，几乎占据冰冻误诊的一半左右，快速冰冻诊断结果正确率通常在95%左右，当然受各家医院条件的影响，不同医院的准确率会有所差距。冰冻免疫组化技术的应用，提高了冰冻快速病理诊断的准确率和精确度，也相应延长了冰冻时间，一般用在病变性质冰冻难以确定时加以辅助诊断。总之，快速病理检查的准确性要低于常规病理诊断。有时候临床为了尽快得到病理报告，而采用快速冰冻的方式，这样十分错误，加大了病理诊断的漏诊或者误诊率。有时取得的标本有限且比较小，冰冻以后没有相应的常规病理报告，导致最后无法最终确诊，对病人十分不利。