医学的角度，目前没有检查能够代替肠镜的检查。在世界范围、中国也启动了大肠癌早期的筛查项目，目的是为把早期肿瘤检测。早期的肿瘤包括异型增生息肉和癌前病变。

对于年龄50岁以上，大便潜血试验有阳性、有家族史的人，进行结肠镜的检查，就会把早期的癌前病变和早期大肠癌检查出来进行治疗、进行处理，避免发生晚期的肿瘤。如果发生晚期的大肠癌，治疗效果比较差，且费用昂贵。

结肠镜的检查没有其他代替方案，对于有绝对禁忌不能做大肠镜的患者，可以做CT，或者钡餐，即肠道气钡造影，可以部分代替结肠镜检查。