腹腔镜下的卵巢打孔术是破坏掉一些卵巢间质，因为卵巢间质是产生雄激素的。多囊卵巢的病人有些就是因为雄激素过高影响排卵和受孕，通过这样的治疗可以达到降低雄激素，改善内分泌状态这样的一个作用。但是这个手术方式已经是作为一个二线的治疗了，它主要的后遗症包括：

1、可能造成卵巢功能的减退。因为可能要把握住打孔的数量和程度，不然如果破坏过多的卵巢组织，会造成卵巢功能的减退，甚至有些特别严重的情况下会造成卵巢早衰的可能；

2、因为通过手术可能会造成一些盆腔的粘连，有些盆腔的粘连可能会造成医源性的再次不孕的因素，影响后面的怀孕。一般来讲多囊卵巢第一步的治疗是通过药物的治疗来达到怀孕的目的，在药物治疗失败的情况下可以选择多囊卵巢的腹腔镜下打孔术，也可以选择试管婴儿助孕技术。