正常情况下，肛周脓肿患者首先应考虑手术治疗，至少95%的肛周脓肿患者需要通过手术治疗。手术的优点是可以去除炎症病灶，同时可以把肛内一些可能形成肛瘘的病灶全部去除，患者只需要术后通过药物治疗，逐渐恢复后，即可治愈。肛周脓肿患者不做手术的危害：
1、炎症有可能会加重，甚至可以导致炎症周围的脓肿加重，形成肌筋膜炎，甚至组织内筋膜炎；
2、肛周脓肿被破坏之后，如果不及时治疗，有可能会形成肛瘘，而肛瘘比肛周脓肿的危害性更大，且肛瘘仅可通过手术治疗。所以肛周脓肿患者应首先选择手术治疗，而不首选保守治疗。早期的肛周脓肿，在局部只是炎症，没有形成脓腔之前，可以考虑予以抗炎治疗，但如果抗炎治疗无效，脓腔形成就必须要采取手术治疗。如果患者的肛周脓肿已经形成脓腔，那么只有手术治疗才可以治愈肛周脓肿。
