儿童牙床肿痛主要是口腔厌氧菌感染，所以一般应用针对厌氧菌较有效的抗菌素，最常见的是红霉素类，首先选择红霉素、克林霉素，对厌氧菌有效。

此外，可选择对厌氧菌有特效的灭滴灵、替硝唑等硝唑类药，对厌氧菌效果较好。因为抗菌素是处方用药，所以应就诊医院开处方，医生会根据病情选择药物。

儿童出现牙床肿痛应就诊正规医院选择口腔科医生，由口腔科医生检查后开具抗菌素，切勿自行购买药物。