显微外科的手术指征，其实适应症还是要适应显微外科的特点。显微外科的特点又涉及到非常微观的方面，要利用显微镜来完成手术操作。显微外科的适应症是所有的在普通外科手术不能完成的高难度的手术，涉及到血管、神经、肌腱以及脑组织、眼部的手术，这些都涉及到显微外科，包括耳廓的内耳手术均涉及显微外科。所有的手术的禁忌症是共同的，手术禁忌症主要包括病人的全身情况，全身情况是否允许，心肺功能是否健康。如果心肺功能影响到手术，对显微外科的手术也有禁忌，因为显微外科手术另外一个特点就是往往显微外科手术的操作非常精密，手术时间非常长，所以对麻醉、病人本身耐受手术的情况、全身的状况都有非常严格的要求。
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