肛周脓肿一旦发生，建议尽早手术，因肛周脓肿单纯保守治疗即抗炎治疗仅部分能得到控制。

即使此次因抗炎治疗好转，在肛周脓肿形成位置会形成炎性硬结，平时无表现、无不适感，但会反复发作，因此肛周脓肿一旦发现，建议尽早手术治疗。不做手术一般肛周脓肿不会自愈，手术方式有很多种，包括单纯切开引流，切开引流后形成肛瘘再做二次手术。现在常用一次性肛周脓肿根治术。手术方式根据实际病情决定，如脓肿特别大、特别深，需先做切开引流，等二次再做根治手术，如脓肿位置较低、范围较小，做一次根治即可解决问题，避免二次痛苦。