孕妇咳嗽有痰的处理方法如下：
1、抗生素治疗：如果是咳脓痰，也就是黄色的痰液，很可能是细菌性上呼吸道感染，可以查一个指血的血常规，看一下白细胞和中性粒细胞的情况。如果白细胞和中性粒细胞升高，证实是细菌感染所导致的上呼吸道感染，可以给予抗生素进行治疗。抗生素在FDA分类里面，挑选B类的抗生素，主要包括青霉素类抗生素、头孢菌素、阿奇霉素等，如果没有过敏史，可以在怀孕期间服用。抗生素治疗以后，症状大多数会有所好转；
2、非药物治疗：如果只是轻微咳嗽，并不是咳脓痰，只是一些轻微、少量的痰液，并不需要进行药物治疗，可以多休息，适当地喝水，可能会缓解咳嗽和咳痰的症状。尤其是在白细胞和中性粒细胞，没有升高的情况下，可以采取一些雾化吸入的办法，缓解咳嗽、咳痰的症状。如果是在秋冬季节，室内较干燥，还可以通过加湿，缓解症状。
