肠内营养粉剂有很多种，分类不是看糖、能量，它的分类主要是看蛋白质，根据肠内营养粉中蛋白质的形式分类。比如最常见的是整蛋白，是用整蛋白水解物作为氮源。另外还有蛋白质短肽、蛋白质氨基酸。氨基酸或者短肽的肠内营养粉，特别适合消化吸收功能发生问题的病人。因为肠道对蛋白质水解的功能受损，所以像放射性肠炎、短肠综合征、肠道功能受到严重损害的病人，可以给短肽型或者氨基酸型肠内营养制剂。市面上最多的肠内营养制剂是水解蛋白，也就是蛋白质比如来自优质的大豆蛋白，经过预先处理，分解成氨基酸、短肽等制剂，适合消化吸收功能发生问题又需要很多营养而普通膳食受限的病人。
